Während Ash sich mit einem Spezialtraining auf die Einall-Liga vorbereitet, beenden die Verbrecher von Team Rocket die Vorbereitungen ihres allerneusten teuflischen Plans: Operation Sturm! Nachdem Meloetta bei einem Trainingskampf zugesehen hat, möchte es auch mitmischen! Gerade als Ash und Rabigator Meloettas Herausforderung angenommen haben, erscheint auf dem Kampffeld ein riesiges Golgantes, auf dessen Rücken sein Trainer Rafael sitz. Rafael macht keinen Hehl daraus, dass er Ash für einen Dieb hält und beschuldigt ihn, Meloetta entführt zu haben! Das Missverständnis ist jedoch schnell aus der Welt geschafft und Rafael erklärt den Gefährten daraufhin, dass er einer von Meloettas Beschützern sei und er und Golgantes schon seit einiger Zeit nach dem Mysteriösen Pokémon suchen, das von einigen unbekannten Verbrechern entführt worden war. Die fraglichen Verbrecher geben sich schnell zu erkennen: Zwei Mitglieder von Team Rocket haben Meloetta auf Cynthias Besitz aufgestöbert und wollen es erneut in ihre Gewalt bringen! Rafael erklärt sich sofort bereit, mit Golgantes gegen sie zu kämpfen, während Ash und die anderen Meloetta in Sicherheit bringen sollen. Unsere Helden ergreifen so schnell sie können die Flucht, doch plötzlich versperren ihnen Jessie, James und Mauzi den Weg! Während Lilia und Benny sich gegen sie zur Wehr setzen, laufen Ash, Pikachu und Meloetta allein weiter. Unglücklicherweise spielen sie dadurch Team Rocket direkt in die Hände, denn der Boss wartet schon auf sie, um sie zu fangen! Giovanni und Snobilikat sperren Ash und Pikachu in einen Käfig. Giovanni rät Meloetta, lieber aufzugeben, da es sonst seinen Freunden schlecht ergehen würde. Meloetta hat keine andere Wahl und so werden die drei in den Helikopter von Team Rocket verfrachtet und dann in ein U-Boot gebracht, das umgehend zu einem alten Tempel auf dem Grund der Bucht von Ondula sinkt. Hilflos muss Ash zusehen, wie Meloetta im Inneren des Tempels in seine Schranken verwiesen wird. Dann lässt Dr. Zager eine Aufzeichnung von Meloettas unvergesslichem Lied abspielen. Durch dieses Lied öffnet sich eine uralte Versiegelung! Der Tempel verwandelt sich und steigt über die Meeresoberfläche der Bucht empor. Sobald der Weg für ihn frei ist, begibt sich Giovanni ins Innere des Tempels, um dort den Wahrspiegel für sich in Anspruch zu nehmen – ein mysteriöser Spiegel mit bislang noch unbekannten Kräften! Aber worum geht es wirklich bei „Operation Sturm“? Könnte sie etwa die größte Bedrohung sein, der die Einall-Region jemals ausgesetzt war?!