Mens vore helte sammen med N fortsætter deres rejse, finjusterer Team Plasma deres onde plan: at indfange og styre alle Pokémon, mens deres raseri og angrebskraft forstærkes maksimalt med dr. Colress’ djævelske apparat. Team Plasmas agenter udspionerer desuden Cedric Juniper og hans team på De Hvide Ruiner – og leder tilsyneladende efter N!
Ash og de andre bliver stoppet af betjent Jenny, der advarer dem om, at broen er lukket på grund af en rasende Haxorus, der hærger byen! Iris ved, at sådan noget ville en Drage-type aldrig gøre uden nogen grund, så vore helte stikker af og leder efter en anden vej ind – i en utæt robåd. Da de kommer ind, virker byen forladt, men så møder de agenten Looker fra Det Internationale Politi, der er i gang med sin egen efterforskning. Ash præsenterer Looker for N, men Looker har allerede genkendt ham som en person, som Team Plasma leder efter. Imens har Team Rocket overværet raseriet og mener, at Haxorus må være Team Plasmas værk (baseret på det, de så i Floccesy Town). Derfor beslutter Jessie, James og Meowth, at hvad det end er for et apparat, der får Pokémon til at gå amok, så vil de have kløerne i det!
Sammen med N finder vore helte den vilde Haxorus og får den til at falde til ro. Men da Iris kalder på sin Dragonite, bruger Colress sit apparat på den, hvilket gør Dragonite rasende! Nu følger der flere kampe, og da Team Plasma opdager N, er det tydeligt, at de kender hinanden. Team Plasma vil have, at N kommer med dem, men det nægter N og beder dem om at lade han være. Og da Iris havner lige midt i et par voldsomme angreb, skubber N hende væk og bliver ramt i stedet – og slået bevidstløs!
Imens har Team Rocket forsøgt at stjæle Team Plasmas luftskib (og hjernevasksmekanismen om bord), mens Team Plasma er optaget andet steds. Det undgår dog ikke deres opmærksomhed længe, og da der opstår kamp, får et uberegneligt angreb fra Team Plasmas Liepard mekanismen til at gå i stykker. Haxorus og Dragonite slipper fri, Colress vil trække sig tilbage, og Team Plasma tager flugten – dog stadig meget bevidste om, at Ghetsis, deres leder, vil have N fanget, koste hvad det vil.
Da Ash, Iris og Cilan forgæves prøver at vække N, opstår en tæt tåge, og to kvinder viser sig. De beder deres Pokémon – Gothitelle og Gardevoir – om at få N til at svæve, hvorefter de går med ham, efterfulgt af vore helte og Team Rocket. Skurketrioen ender på en klippekant, mens vore helte, længere nede, overværer, at kvinderne nedsænker N i vand. Hvad gør de ved ham? Få svaret, for rejsen fortsætter!
