Uden for Dragespiraltårnet møder Ash, Cilan og Iris professor Cedric Junipers assistent, der tilbyder dem et lift, så de kan møde professoren på De Hvide Ruiner. På vejen fortæller han, at udgravningsholdet har gjort en fantastisk opdagelse, men vil ikke sige mere. Inde i ruinerne genforenes vore helte med Cedric, der viser dem en dør, som er dækket af mystiske symboler. Efter at have flyttet nogle få paneler rundt åbner døren sig! Der, lige for øjnene af dem, er Lysstenen – et artefakt, der ifølge legenden skulle være Reshiram i en anden form! Professoren samler stenen op, hvorefter den bryder ud i flammer mellem hænderne på ham og sender en lyseksplosion højt op i luften, men uden at skade professoren.
N ser lysglimtet på afstand og kan mærke Reshirams tilstedeværelse, hvorefter han baner sig vej til ruinerne. Her overrasker han professor Juniper og de andre, mens han kræver at få at vide, hvad professorens planer er med stenen. Så forklarer Cedric, at Lysstenen og Reshiram er en del af hans livsværk, og at han vil undersøge stenen nøje. Det kan N ikke acceptere og skrider til handling ved at gribe beholderen med stenen og løbe sin vej. Ash løber efter ham, men jorden giver efter under hans fødder. Det får N til at komme tilbage for at hjælpe ham – han slipper endda beholderen for at gribe Ash’ hånd – men falder selv i hullet, hvorefter de to lander på blødt sand langt under jorden.
Oppe i dagslyset prøver de andre at finde ud af, hvordan de får Ash og N op, da de får uventede gæster: Team Plasma! Skurkene har også set lyseksplosionen fra stenen og fulgte den til ruinerne i håb om at få fingre i både N og Lysstenen. De er parate til at angribe Iris, Cilan og Cedric, da professorens assistent afslører sin sande identitet: Det er Detektiv Looker fra Det Internationale Politi! Denne trænger Team Plasmas Aldith op i et hjørne og siger, at der er forstærkninger på vej, men så aktiverer Colress sit nu fuldendte apparat og opnår dermed kontrol over den Golurk, der har hjulpet dem med udgravningen og nu vender sig mod vore helte!
Jessie, James og Meowth har sporet Team Plasma, men beslutter at læne sig tilbage og vente på, at støvet lægger sig, før de styrter ind og stjæler Lysstenen og Pikachu.
Under jorden har N og Ash en længere samtale om forholdet mellem mennesker og Pokémon. N synes stadig, at Pokémon ville være bedst tjente uden mennesker, men Ash insisterer på, at han bare vil vide mere om Pokémon og være rigtigt gode venner med dem – også Reshiram! Men så hører de kamplyde ovenfra og beslutter, at de er nødt til at finde en vej ud. Hvem gør krav på Lysstenen, når kampen er forbi?