Under deres jagt på Team Flare og Smatte møder Team Rocket en Pokémon, som ligner den, nemlig Z2...og Team Flare er lige i hælene på den! Nu følger en kamp frem og tilbage mellem de to parter, under hvilken Z2 skifter hænder adskillige gange - indtil den fusionerer med flere Celler og bliver til en stærk og truende øgleagtig Pokémon, der får jorden til at ryste under sine angreb!
Z2 har en klar fordel, men Lysandre har tilkaldt forstærkning! Med hjælp fra Alain og hans Mega-Charizard lykkes det Team Flare at bekæmpe Z2 og lukke den inde i et bur. Men i vore heltes lejr krammer Bonnie sin Smatte, som er trist og bekymret, mens hun prøver at finde ud af, hvad der er galt...