Durante una visita a la Muralla Costera antes de la Batalla de Gimnasio de Ash en Ciudad Cyllage, nuestros héroes se encuentran pescando cuando Ash saca un Skrelp, ¡el cual ataca a Pikachu con veneno! Afortunadamente, conocen a una pareja en el camino de la playa que cura a Pikachu con un útil Antídoto. Eddy y Lindsey son arqueólogos submarinos en busca de El Cussler, un crucero de lujo que se hundió hace muchos años, y nuestros héroes deciden ayudarlos con su búsqueda. Mientras Clemont y Bonnie se quedan en la superficie con Eddy, Ash y Serena van con Lindsey en el submarino y se sumergen hacia el lecho del océano. Como pensaban, los restos de El Cussler están ahí, y gracias a un astuto Dragalge que lo ha fusionado con Ácido, se ha vuelto el hogar de muchas clases diferentes de Pokémon tipo Agua.

Una misteriosa luz los atrae cada vez más cerca de los restos del barco, donde encuentran el submarino del Equipo Rocket. Los villanos han venido a llevarse el tesoro hundido de El Cussler, y su interrupción ha dañado la estructura del barco. Con un poco de ayuda de nuestros héroes, los Pokémon salvajes consiguen arreglar su refugio submarino mientras el Equipo Rocket escapa con la caja fuerte de El Cussler, ¡sólo para quedar atrapados en un remolino! Skrelp también queda atrapado, pero Froakie llega al rescate, mostrando sus espectaculares habilidades de salto… ¡y dándole a Ash ideas para usar en su próxima Batalla de Gimnasio contra Grant!