Tras descubrir que una señal que se cree proviene de Mew viene de una isla distante, Ash y Goh parten a investigar. Ahí encuentran un bosque repleto de Pokémon salvajes, incluyendo un grupo de Pokémon que parecen inexplicablemente temerosos. Ellos siguen a los Pokémon y, para su sorpresa, ¡Mewtwo aparece! Ambos comparten sus respectivas metas con Mewtwo, y él acepta tener una batalla, pero su increíble poder es apabullante. Tras ser derrotados, Ash y Goh se dan cuenta de que Mewtwo ha estado protegiendo a los Pokémon que fueron maltratados por los humanos. ¡Mewtwo y los Pokémon desaparecen, mientras Ash y Goh se encuentran en completo asombro por todo lo que han experimentado!