Mientras que Ash está haciendo un Entrenamiento Especial en casa de Cintia para prepararse para la Liga de Teselia, los villanos del Team Rocket terminan sus preparativos para poner en marcha su último plan diabólico: la Operación Tempestad.

 Tras presenciar un combate de entrenamiento, Meloetta quiere entrar en acción. Ash y Krookodile aceptan el desafío de Meloetta y, de repente, un enorme Golurk desciende sobre el campo de batalla montado por su Entrenador, Ridley, que enseguida acusa a Ash de ser un villano y de robar a Meloetta. El malentendido se aclara rápidamente. Ridley explica que es uno de los Protectores de Meloetta y que Golurk y él llevan buscando mucho tiempo al Pokémon singular, después de que unos villanos desconocidos lo secuestraran.

 Los villanos en cuestión pronto se dan a conocer: un par de agentes del Team Rocket han rastreado a Meloetta hasta la casa de Cintia con la intención de volver a capturar al Pokémon. Ridley y Golurk deciden combatir contra ellos, mientras que Ash y los demás intentan poner a salvo a Meloetta. Pero, al poco tiempo, Jessie, James y Meowth interfieren en su camino. Iris y Millo se enfrentan a ellos, mientras que Ash, Pikachu y Meloetta continúan solos.

 Por desgracia, caen en la trampa del Team Rocket y son atrapados, puesto que el Jefe los estaba esperando. Giovanni y su Persian encierran a Ash y a Pikachu en una jaula y ordenan a Meloetta que se rinda o sus amigos sufrirán daños. Meloetta no tiene elección y suben a los tres al helicóptero del Team Rocket para trasladarlos después a un submarino que desciende hasta un templo en ruinas en el fondo de Bahía Arenisca.

 Ash observa impotente cómo inmovilizan a Meloetta dentro del templo. El Doctor Zager pone una grabación de la evocadora canción de Meloetta que abre el antiguo sello, transformando el templo y elevándolo a la superficie de la bahía. En cuanto el camino está despejado, Giovanni se dirige hacia la parte más profunda del templo y se apodera del Espejo Veraz, un espejo místico con poderes desconocidos. ¿De qué va en realidad la Operación Tempestad? ¿Podría ser esta la mayor amenaza a la que se ha enfrentado la región de Teselia a lo largo de toda su historia?