La ceremonia de la entrega de premios de la Liga de Kalos se ve interrumpida por unas lianas gigantescas y horribles que envuelven el estadio y amenazan con apoderarse de Ciudad Luminalia. Lysson da a conocer a los habitantes, los planes del Team Flare. Quieren crear un nuevo orden mundial, donde solo los "elegidos" se unirán a ellos.
Ash y Alain parten a rescatar a Mairin, pero Ash se queda sorprendido al descubrir que Alain ha estado trabajando con Lysson, y el Team Flare encierra a Ash en la cima de la Torre Prisma. Sus amigos tratan de ayudarlo, pero un furioso Zygarde se interpone en su camino. Pero un segundo Zygarde se enfrenta a él, puesto que Blandín se transforma y revela su verdadera identidad. Se aproxima una gran batalla, de Zygarde contra Zygarde.