La amenaza de Lysson contra el mundo continúa, pero nuestros héroes se han separado y contraatacan desde distintos frentes. Ash y Alain se enfrentan a Lysson en una batalla, y Malva se solidariza con ellos. Mientras tanto, Clem se enfrenta al amenazante Zygarde y le canta entre lágrimas y con valentía su canción de Blandín. Zygarde vuelve a conectar con su amiguita, y la influencia del Team Flare se desvanece.
Lem entra en la Torre Prisma para derrotar a Xero, y Lembot se conecta al sistema de control con la intención de apagarlo. Al hacerlo, borrará su memoria, pero Lembot insiste en que no tienen elección, y Lem accede a hacerlo con gran tristeza. Al completar la desconexión, la máquina del Team Flare se apaga... de momento.