Tras cotillear en una clase de Ash mientras aprenden cosas sobre los Cristales Z, el Team Rocket se empeña en tener uno. Gracias a la investigación de James, localizan un Cristal Z de tipo Siniestro incrustado en una roca a mucha altura y protegido por un gigantesco Pokémon dominante, un Raticate de Alola. Pero el Team Skull también está allí, y da comienzo la rivalidad.

Tupp, el líder de pelo azul de los tres villanos del Team Skull, es el primero en alcanzar el Cristal Z. Consigue arrancar el cristal de la roca, pero este sale volando y golpea a Meowth en la cabeza. Ahora que el Team Rocket tiene el Cristal Z, solo tiene que averiguar cómo se usa.