Tras enterarse de que una señal, que se cree que podría ser de Mew, ha sido detectada en una isla lejana, Ash y Goh se disponen a investigar. Allí encuentran un bosque repleto de Pokémon salvajes, entre ellos, una pandilla de Pokémon que son inexplicablemente asustadizos. Siguen a dichos Pokémon y, para su sorpresa, ¡aparece Mewtwo! Comparten sus respectivos objetivos con Mewtwo, y este acepta librar un combate, pero su poder es abrumador. Tras ser derrotados, Ash y Goh se dan cuenta de que Mewtwo ha estado protegiendo Pokémon que han sido maltratados por los humanos. Mewtwo y los Pokémon se despiden, y Ash y Goh se quedan alucinados con todo lo que han experimentado.