Matkustaessaan laivalla kohti Chocovine Townia, missä Dawnin seuraava Pokémonkilpailu pidetään, sankarimme alkavat ihmetellä, minne Pikachu ja Piplup ovat häipyneet. Käy ilmi, että ne ovat päätyneet laivan osaan, missä ne eivät saisi olla. Piplup haluaa leikkiä, mutta Pikachu tietää, että se on kiellettyä ja haluaa lähteä. Yllättäen naamioitunut Rakettiryhmäläinen ilmaantuu ja kaappaa ne sukellusveneeseensä. Sankarit huomaavat tämän juuri, kun Rakettiryhmä on lähdössä. Ash ja Buizel säntäävät perään, mutta joutuvat yhtäkkiä vahvan virtauksen pyörteisiin, ja vaikka konstaapeli Jenny pelastaa heidät, Pikachu ja Piplup lentävät ulos Rakettiryhmän sukellusveneestä ja päätyvät autiolle saarelle.
Sieltä Pokémonkaksikko löytää suuren Pokémonryhmän, mukaanlukien Corphishin, joka kertoo omituisesta hehkuvasta kivestä, jota kaikki Pokémonit yrittävät auttaa. Pikachu ja Piplup tarjoavat nekin apuaan ja ystävystyvät oudon hehkuvan kiven kanssa. Tässä vaiheessa sankarimme ja konstaapeli Jenny saapuvat hekin paikalle ja ilmenee, että hehkuvan kiven sisällä on Deoxys, joka kerää energiaa yhdestä saaren pintaa täplittävistä meteoreista.
Kun Rakettiryhmä ilmaantuu jälleen ja yrittää varastaa Deoxysin, he joutuvat taas häippäisemään voimalla, ja Deoxys suojaa Ashiä ja tämän ystäviä putoilevalta rojulta.
Sankarimme kiittävät Deoxysiä, joka lähtee taas matkaan, ja hämmästelevät sitä, miten monia ihmeellisiä Pokémoneja he vielä tulevatkaan kohtaamaan. Sitten he lähtevät jälleen Chocovine Townin suuntaan.
Matkustaessaan laivalla kohti Chocovine Townia, missä Dawnin seuraava Pokémonkilpailu pidetään, sankarimme alkavat ihmetellä, minne Pikachu ja Piplup ovat häipyneet. Käy ilmi, että ne ovat päätyneet laivan osaan, missä ne eivät saisi olla. Piplup haluaa leikkiä, mutta Pikachu tietää, että se on kiellettyä ja haluaa lähteä. Yllättäen naamioitunut Rakettiryhmäläinen ilmaantuu ja kaappaa ne sukellusveneeseensä. Sankarit huomaavat tämän juuri, kun Rakettiryhmä on lähdössä. Ash ja Buizel säntäävät perään, mutta joutuvat yhtäkkiä vahvan virtauksen pyörteisiin, ja vaikka konstaapeli Jenny pelastaa heidät, Pikachu ja Piplup lentävät ulos Rakettiryhmän sukellusveneestä ja päätyvät autiolle saarelle. Sieltä Pokémonkaksikko löytää suuren Pokémonryhmän, mukaanlukien Corphishin, joka kertoo omituisesta hehkuvasta kivestä, jota kaikki Pokémonit yrittävät auttaa. Pikachu ja Piplup tarjoavat nekin apuaan ja ystävystyvät oudon hehkuvan kiven kanssa. Tässä vaiheessa sankarimme ja konstaapeli Jenny saapuvat hekin paikalle ja ilmenee, että hehkuvan kiven sisällä on Deoxys, joka kerää energiaa yhdestä saaren pintaa täplittävistä meteoreista. Kun Rakettiryhmä ilmaantuu jälleen ja yrittää varastaa Deoxysin, he joutuvat taas häippäisemään voimalla, ja Deoxys suojaa Ashiä ja tämän ystäviä putoilevalta rojulta. Sankarimme kiittävät Deoxysiä, joka lähtee taas matkaan, ja hämmästelevät sitä, miten monia ihmeellisiä Pokémoneja he vielä tulevatkaan kohtaamaan. Sitten he lähtevät jälleen Chocovine Townin suuntaan.