Pysähdyttyään matkallaan Nimbasa Cityyn nukkumaan, sankarimme heräävät ohitse lentävään Ufoon. Seuraavana päivänä he pysähtyvät kahvilaan keskustelemaan edellisen yön tapahtumista ja kuulevat samalla paikallisten kertovan tarinaa ystävästään, joka oli nähnyt ilmestyksen ulkoavaruudesta ja kuinka he olivat menneet Professori Icaruksen luo (hän asuu vuorella) kysymään häneltä asiasta. Kyseisestä tiedemiehestä (Ufo-asiantuntija) tiedetään hyvin vähän, mutta paikallisten kohdatessa hänet, he kaikki kärsivät vakavasta päänsärystä. Cilan on professorin suuri ihailija ja päättää että sankareidemme on mentävä professorin kotilaboratorioon selvittämään mysteeriä. Ylittäessään siltaa he saavat ilmestyksen tulevasta vaarasta.
Sillä väli rakettiryhmä on tarkkaillut salaa professorin kanssa asuvaa Elgyem-pokémonia aikoen siepata sen itselleen.
Sankarimme saapuvat professorin talolle. Cilanin selityttä olevansa professorin suuri ihailija, Icarus heltyy ja pyytää heidät kotiinsa. Selitettyään heille teoriansa pimeästä aineesta ja kerrottuaan että heidän näkemänsä UFO oli hänen rakentamansa lentävä lautanen, sankarimme saavat ilmestyksen räjähtävästä lentävästä lautasesta! Syöksyessään kohti laboratoriota, he kohtaavat Elgyemin, ja saavat tietää että Elgyem ja professori asuvat yhdessä. Sankarimme saavat myös tietää, kuinka Icarus ja Elgyem tapasivat.
Käy ilmi, että Elgyem on vastuussa kaikkien näkemistä ilmestyksistä. Samassa naamioitunut rakettiryhmä ilmestyy paikalle ja yrittää siepata Elgyemin. Alkaa hurja ottelu, josta sankarimme selviävät voittajina, tosin eivät ennen kuin rakettiryhmä tuhoaa professorin lentävän lautasen.
Professori ei asiasta huolestu ja vannoo rakentavansa uuden lentävän lautasen ja vievänsä Elgyemin takaisin ulkoavaruuteen. Näyttää kuitenkin siltä, että Elgyem viihtyy olinpaikassaan. Lopulta sankarimme jättävät jäähyväiset professorille ja Elgyemille ja suuntaavat taas kohti Nimbasa Cityä.