Jatkaessaan yhdessä matkaansa sankarimme ja N kohtaavat joukon Plasmaryhmäläisiä, jotka käyttävät viattomia Pokémoneja koekaniineinaan! Hurjan kamppailun aikana N joutuu ristituleen ja vahingoittuu vakavasti. Kaksi salaperäistä naista tulee sumun seasta. He vievät tajuttoman N:n metsän keskellä olevalle lammelle, jonne he upottavat hänet sankareidemme seuratessa vaitonaisina tapahtumia.
Ashin ja ystävien seuratessa hämmästyneenä N parantuu vammoistaan! Pian käy ilmi, että N ja hänen kaksi naiskumppaniaan, Concordia ja Anthea, asuvat salaisessa piilopaikassa, joka toimii myös turvapaikkana loukkaantuneille Pokémoneille.
N kuvaa lapsuuttaan suuressa kartanossa, jossa häntä pidettiin aina sisällä. Hän, Concordia ja Anthea saivat kuulla kuinka Ghetsis, Plasmaryhmän johtaja, kertoi että heidän kykynsä ymmärtää Pokémonien sisäistä ääntä estäisi ihmisiä vahingoittamasta Pokémoneja. Mutta Ghetsiksen saadessa vastaansa legendaarisen, ja erittäin vihaisen Reshiramin, he tajuavat Ghetsiksen valehdelleen heille alusta lähtien.
N ja hänen kumppaninsa ovat edelleen sitä mieltä, ettei ihmisiin voi luottaa Pokémonien hyvinvoinnin suhteen ja että Pokémonien pitäisi pysytellä erillään ihmisistä. Sankarimme yrittävät kuitenkin muuttaa heidän mielensä. Pian Anthea ja Concordia hämmästelevätkin huonosti kohdeltujen Pokémonien uskaltaessa leikkiä nuorten kouluttajien kanssa!
Plasmaryhmän kätyrien löytäessä N:n piilopaikan alkaa jälleen ankara kamppailu. Sankarimme ovat tehtäviensä tasalla ja Plasmaryhmä kärsii tappion – toistaiseksi!
N, Anthea ja Concordia ovat silti yhä sitä mieltä, etteivät ihmiset ja Pokémonit voi elää rinnakkain, joten he hyvästelevät sankarimme ja katoavat sumuun. Ash ystävineen jää pohtimaan näkevätkö he N:ää enää koskaan.