Sankareittemme vieraillessa ystävänsä Sanpein luona Ninjakylässä, sen päällikkö Hanzo joutuu salaperäisen ninjajoukon sieppaamaksi! Heidän johtajansa on Kagetomo, lahjakas ninja, joka haluaa päälliköksi Hanzon paikalle. Sanpei veljineen päättää vapauttaa päällikkönsä, joten he käyvät Kagetomon ja hänen joukkonsa kimppuun Ashin, Serenan ja Clemontin avulla. Ottelun aikana Ashin Frogadier kehittyy valtavan voimakkaaksi Greninjaksi! Ninjajoukko kokee tappion ja Kagetomo näkee tekemänsä virheet päättäen muuttaa elämänsä. Ash ystävineen nauttii kyläjuhlista, jossa Hanzo nimeää Sanpein vanhimman veljen, Ippein, seuraavaksi päälliköksi. Sankareittemme lähdettyä, toiseksi vanhin veli, Nihei, kertoo muille nähneensä jotain Ashin Greninjassa, joka muistutti häntä kylän muinaisesta sankarista...