Une nouvelle aventure commence dans le vaste monde des Pokémon ! Arrivée à l’Académie Indigo, une petite fille nommée Liko reçoit son premier partenaire Pokémon, Poussacha. Elle est bientôt poursuivie par les Explorateurs, un groupe mystérieux, décidé à voler le pendentif qu’elle porte. Cependant, Liko n’est pas seule : Friede, Capitaine Pikachu et les autres Électacleurs Volants la protègent et l’accueillent à bord de leur dirigeable. Pendant ce temps, un garçon nommé Rhod rêve de devenir Dresseur Pokémon, ignorant le secret caché dans la Poké Ball ancienne qu’il porte. Liko, Rhod et les Électacleurs Volants partent ensemble pour de nouveaux horizons. Quelles découvertes les attendent ?