Nos héros se retrouvent perdus dans les nombreuses galeries qui traversent le Mont Foré. Heureusement, ils rencontrent un Chercheur Pokémon nommé François, qui vient de découvrir un fossile du Pokémon Tortantique préhistorique, Carapagos. Nos héros et François sont bientôt chassés de la montagne par l'amie d'enfance de ce dernier, Lina, qui dirige une mission d'extraction minière. François invite tout le monde chez lui et explique que lorsqu'il était enfant, il a rencontré un Carapagos et a joué avec lui dans la montagne. Nos héros et François lui-même sont persuadés que cela n'a été possible que grâce à une faille dans l'espace-temps. Pendant ce temps, la Team Rocket projette le vol du fossile dans l'intention de le ramener à la vie. Ils comptent voyager dans le passé en utilisant la même faille dans l'espace-temps que celle que François a franchie lorsqu'il était enfant et a rencontré Carapagos. Mais si la Team Rocket veut rejoindre le monde préhistorique, c'est pour se procurer des Pokémon dont les espèces ont depuis disparu, les ramener dans le monde contemporain, et s'en servir pour prendre le contrôle de toute la région d'Unys. Nos héros n'ont bien sûr pas l'intention de les laisser faire et un terrible combat s’ensuit. Mais la Team Rocket s'est entourée de protections très efficaces et nos héros ont bien du mal à les franchir. Soudain, le Carapagos restauré s'échappe, et Sacha et François se lancent à sa poursuite. Lorsque l'épisode se termine, ils tentent de convaincre un Carapagos furieux qu'ils ne lui veulent aucun mal, tandis que la Team Rocket reste déterminée à le capturer pour prendre enfin le contrôle de toute la région d'Unys.