Alors que Sacha s'entraîne dur dans la maison de vacances de Cynthia pour se préparer aux combats de la Ligue d'Unys, les membres de la Team Rocket finissent de mettre au point l'ultime étape de leur plan diabolique : l'Opération Tempête ! Après avoir regardé un combat d'entraînement, Meloetta veut prendre part à l'action ! Sacha et Crocorible acceptent de s'entraîner avec elle, lorsqu'un énorme Golemastoc atterrit dans la zone de combat. Son Dresseur, Hugo, accuse immédiatement Sacha d'être un bandit et d'avoir kidnappé Meloetta ! Ce malentendu est vite dissipé, et Hugo explique qu'il est l'un des Protecteurs de Meloetta, et que Golemastoc et lui veillaient sur ce Pokémon fabuleux lorsque des bandits mystérieux ont kidnappé Meloetta ! Les bandits en question se font vite connaître ; ce sont les membres de la Team Rocket, qui ont suivi Meloetta jusqu'à la maison de Cynthia pour tenter de la capturer à nouveau. Hugo annonce que Golemastoc et lui vont arrêter ces malfaiteurs. Sacha et les autres sont chargés de mettre Meloetta hors d'atteinte. Ils s'enfuient mais sont arrêtés par Jessie, James et Miaouss ! Iris et Rachid les affrontent, alors que Sacha, Pikachu et Meloetta continuent seuls. Malheureusement, ils tombent entre les mains de la Team Rocket et de leur chef ! Giovanni, aidé de son Persian, enferme Sacha et Pikachu dans une cage, puis il ordonne à Meloetta de se rendre ou bien ses amis le paieront cher ! Meloetta n'a pas le choix, et tous les trois sont embarqués à bord de l'hélicoptère de la Team Rocket, puis dans un sous-marin. Ils atteignent les ruines d'un temple au fond de la Baie Vaguelone. Sacha, impuissant, regarde Meloetta prisonnière dans le temple. Le Dr Zékor commence à passer un enregistrement du chant lancinant de Meloetta, qui déverrouille un sceau magique, ramenant alors le temple à la surface de la baie. Dès que le passage est dégagé, Giovanni se fraye un chemin dans le temple et obtient le Miroir Sacré. Il s’agit d’un miroir mythique aux pouvoirs extraordinaires ! Quel est le but ultime de l'Opération Tempête ? C'est en tout cas la plus terrible menace qui ait jamais pesé sur la région d'Unys.