Voyageant par bateau vers les Ruines Blanches où se trouve Spruce, le père du Professeur Keteleeria, nos héros rencontrent un jeune homme étrange qui se présente sous le nom de N. N leur explique qu'il considère tous les Pokémon comme ses amis et affirme qu’il peut entendre leur voix intérieure. Il est aussi très heureux d’avoir capté le lien très fort qui unit Sacha et Pikachu.

Sacha mentionne qu'ils sont en route pour étudier le Pokémon légendaire Reshiram, et comme N semble intéressé, Sacha lui raconte comment il a pu voir Zekrom. N se lance dans une description passionnée de ses projets – résoudre le mystère de la présence des Pokémon dans le monde, rencontrer Reshiram et Zekrom, et améliorer la vie des Pokémon. Cela plaît à Sacha… mais il comprend rapidement que lui et N n’ont pas la même façon de voir les choses lorsque N désapprouve les combats Pokémon, disant qu’il n'aime pas l'idée de forcer des amis à se battre l'un contre l'autre.

En attendant, la Team Rocket complote toujours l’enlèvement de Pikachu pour l’offrir à son Boss. Ils attirent d'abord Coupenotte loin de nos héros tandis que Sacha et Iris se livrent à un combat. Puisque Pikachu suit de près son ami, les deux Pokémon se retrouvent vite prisonniers de la Team Rocket. Heureusement, avec l’aide de N, ils sont bientôt libérés, mais pas avant qu'une attaque du Gaulet de James n'empoisonne le pauvre Pikachu. Sacha ne sait pas quoi faire, mais N a un plan : il emmène tout le monde sur le pont du bateau et appelle ses amis, des Mamanbo sauvages, qui utilisent Régénération pour guérir Pikachu !

Le bateau accoste à la ville de Volucité où N doit aller, mais il affirme à nos héros qu'ils se rencontreront de nouveau. En partant, il réfléchit à ce que la rencontre de Zekrom pourrait signifier pour Sacha… Il semble convaincu que cette expérience changera sa vie !