Alors que nos héros sont en visite dans le Village Ninja natal de leur ami Sanpei, le chef Hanzo est capturé par un groupe de mystérieux ninjas ! Leur chef est Kagetomo, un Ninja talentueux, persuadé qu’il devrait être chef à la place d’Hanzo. Sanpei et ses frères sont bien décidés à libérer leur chef, et ils affrontent courageusement Kagetomo et ses hommes de main, avec l’aide de Sacha, Serena et Clem. Au cours du combat, le Croâporal de Sacha évolue en un Amphinobi particulièrement puissant ! Les ninjas rebelles sont vaincus, et Kagetomo réalise son erreur. Il décide alors de reprendre l’entraînement et de quitter le village. Sacha et ses amis restent pour profiter du festival du village, au cours duquel Hanzo désigne Sanpei, le frère aîné d’Ippei, comme son successeur. Après le départ de nos héros, le second frère, Nihei, dit aux autres qu’il a vu quelque chose dans l’Amphinobi de Sacha qui lui a rappelé l’ancien héros du village...