Flora s'aperçoit qu'il lui manque deux Poké Balls et elle accuse immédiatement la Team Rocket, mais les trois bandits qui se cachaient justement dans les environs clament leur innocence. Peu de temps après, nos héros rencontrent un garçon qui leur explique que le véritable coupable est sûrement son Linéon, qui depuis qu'il a évolué en Zigzaton ne cesse d'éviter son Dresseur et d'accumuler divers objets, allant jusqu'à prendre des choses qui ne lui appartiennent pas. Tandis que nos héros cherchent les Poké Balls manquantes, Sacha partage son expérience avec le Dresseur de Linéon dans l'espoir de restaurer les liens autrefois si puissants qui unissaient le garçon à son Pokémon. Pendant ce temps, la Team Rocket tente de s'emparer de ce Pokémon, déjà aguerri dans l'art du vol...