La città tecnologica di LaRousse è un posto davvero interessante da visitare e in cui affrontare una battaglia tra Pokémon! Ash si dirige subito verso la Torre Lotta, ma le cose non sembrano andare troppo bene quando scopre che il suo compagno di lotta è un ragazzino spaventato. A causa di un terribile trauma subito nell'infanzia, Tory, questo il nome del ragazzino, ha paura di tutti i Pokémon, persino di quelli carini come Pikachu!
Il terrore aumenta all'arrivo di Deoxys, che assume il controllo della città, disattivando tutti i macchinari e imprigionando gli abitanti. Tuttavia, il Pokémon Leggendario Rayquaza si ribella ed è pronto a fare tutto il necessario per estirpare l'invasore dal suo territorio! Naturalmente Ash, Tory e tutti i loro amici non assistono passivi agli eventi e sono pronti alla lotta!