In un remoto laboratorio, lo scienziato Acromio compie degli esperimenti su un Galvantula terrorizzato nel tentativo di aumentarne il potere utilizzando le onde elettromagnetiche. Sembra che faccia parte di una misteriosa organizzazione chiamata Team Plasma che mira al controllo della regione di Unima… Nel frattempo, i nostri eroi si stanno dirigendo verso le Rovine Bianche passando per Venturia quando vengono attaccati da tre Amoonguss inferociti! Ash, Iris e Spighetto li sconfiggono e li portano quindi al Centro Pokémon che è inaspettatamente strapieno! L’Infermiera Joy spiega che molti dei Pokémon che vivono in montagna hanno iniziato a scendere in città e ad attaccare le persone senza alcun motivo apparente, inoltre un Allenatore riferisce di avere visto alcuni sconosciuti aggirarsi nei pressi di un osservatorio abbandonato sulla cima. Ash e gli altri decidono di investigare sul fatto e si stanno dirigendo su per la montagna quando un tipo barbuto cerca di dissuaderli poiché troppo pericoloso. E dimostra di avere ragione quando i Pokémon, inclusi Pikachu e Axew, si rivoltano improvvisamente contro il gruppo e si lanciano all’attacco! L’uomo attiva un congegno che protegge i Pokémon dall’influenza delle onde elettromagnetiche  e, intanto che si stanno tranquillizzando, si toglie il travestimento: è l’agente Bellocchio della Polizia Internazionale apparso l’ultima volta mentre stava dando la caccia al Team Galassia nella regione di Sinnoh e ora invece sulle tracce del Team Plasma! Li ha seguiti fino all’osservatorio abbandonato e, naturalmente, i nostri eroi decidono di unirsi a lui per aiutarlo. Durante lo scontro con il Team Plasma nell’osservatorio, Acromio decide che Pikachu potrebbe essere il soggetto perfetto per i suoi esperimenti. Il momento è critico poiché Pikachu deve lottare contro il controllo della macchina di Acromio… ma il legame tra Ash e Pikachu è più forte di qualsiasi onda elettromagnetica e Pikachu riesce a liberarsi. Acromio è sbalordito da questo sviluppo quando nota uno strano marchingegno collegato alla sua apparecchiatura: è uno strumento del Team Rocket che riesce a rubare una parte del programma e a liberare allo stesso tempo i Pokémon dall’influenza dello scienziato, e che quindi si dà alla fuga a bordo della loro mongolfiera. Tuttavia un missile lanciato dall’aereo del Team Plasma li fa saltare in aria per l’ennesima volta. Non appena Bellocchio capisce che i macchinari rimasti sono impostati per l’autodistruzione, guida velocemente tutti fuori dall’edificio prima che l’osservatorio salti in aria, distruggendo tutte le prove della presenza del Team Plasma e degli esperimenti di Acromio. Bellocchio giura quindi di voler andare a fondo del piano malvagio del Team Plasma; Ash e gli altri gli augurano buona fortuna accomiatandosi mentre loro riprendono il viaggio verso le Rovine Bianche.