Mentre i nostri eroi e N continuano il loro viaggio, il Team Plasma sta mettendo a punto il suo piano malefico: usare il dispositivo costruito dal Professor Acromio per controllare tutti i Pokémon scatenando al massimo la loro furia e il loro potere d’attacco. Alcuni seguaci del Team Plasma stanno tenendo d’occhio il Professor Aralia e la sua squadra di ricerca alle Rovine Bianche, altri invece sono sulle tracce di N!
Nel frattempo, l’agente Jenny interrompe il viaggio dei nostri eroi: tutti i ponti d’accesso alla città sono chiusi a causa di un Haxorus fuori controllo che sta terrorizzando tutti! Iris sa bene che un tipo drago non farebbe nulla di tutto ciò senza motivo. I nostri eroi decidono dunque di trovare un altro modo per arrivare in città: una barchetta che fa acqua. Una volta arrivati, la città sembra deserta finché non si imbattono nell’agente Bellocchio della polizia internazionale. Spighetto presenta N a Bellocchio ma quest’ultimo l’ha già riconosciuto: è il ragazzo ricercato dal Team Plasma! intanto il Team Rocket ha assistito a tutta la scena e capisce che il comportamento aggressivo dell’Haxorus è opera del Team Plasma (ricollegandosi a ciò che hanno visto a Venturia). Non importa che strumento stia usando il Team plasma: Jessie, James e Meowth hanno già deciso che deve essere loro.
Quando i nostri eroi e N trovano l’Haxorus infuriato, cercano di tranquillizzarlo. Iris chiama in aiuto Dragonite, ma Acromio usa il suo dispositivo su di lui e Iris non riesce più a controllare il Pokémon. Gli scontri e gli attacchi si susseguono e quando il Team Plasma approccia N, diventa chiaro per tutti che N è una loro vecchia conoscenza. Il Team Plasma vuole che N torni nel gruppo ma N si rifiuta dicendo che vuole essere lasciato in pace. In seguito, N cerca di placare i due Pokémon ma viene scagliato via dai loro attacchi e cade a terra perdendo i sensi.
Il Team Rocket ne approfitta per rubare l’elicottero del Team Plasma (dove si trova anche il congegno di Acromio). Ma non passano inosservati. Mentre la battaglia incalza, un attacco del Liepard del Team Plasma fa saltare i circuiti del dispositivo di Acromio. Haxorus e Dragonite tornano alla normalità e il Team Plasma è costretto a ritirarsi senza riuscire a catturare n come ordinato da Ghecis.
Mentre Ash, Iris, Spighetto cercano invano di svegliare N, scende una nebbia misteriosa e appaiono due figure femminili che con l’aiuto dei loro Pokémon, Gothitelle e Gardevoir, portano via N. I nostri eroi le seguono, pedinati a loro volta dal Team Rocket che presto si ritrova bloccato sul ciglio di un burrone, mentre N viene immerso in un laghetto. Che cosa gli staranno facendo? Alla prossima puntata la risposta, perché il viaggio continua!