Als onze helden op Milos Island zijn aangekomen ontmoeten onze helden samen met eilandbewoner Lewis, de Legendarische Pokémon Tornadus en Thundurus. De stenen spies die zijn neergezet om ze van het eiland af te houden, zijn vernietigd (door Team Rocket) en nu houden ze een heftig gevecht tegen elkaar, waardoor het behoud van het eiland op het spel komt te staan. Landorus ( de Legendarische Pokémon die al eerder Tornadus en Thundurus had verslagen) wordt aangeroepen en er volgt een gevecht tussen de drie Legendarische Pokémon. Maar als blijkt dat Thundurus en Tornadus, Landorus hebben verslagen, geven Lewis en Gothorita het kleine beetje Opwekkingskruid dat ze nog over hebben aan Landorus, die onmiddellijk opknapt! Nadat Landorus, Tornadus en Thundurus ervan overtuigd heeft op te houden met vechten, werken de drie Legendarische Pokémon samen om Milos Island weer in zijn ongerepte staat terug te brengen. Het Opwekkingskruid begint in grote hoeveelheden te groeien. En onze helden verlaten het eiland met een zak vol kruiden voor Gym Leader Clay! Ze nemen afscheid van Lewis en keren terug naar de Driftveil Gym.