Team Plasma werkt nog steeds aan haar snode plan; Pokémon vangen om te gebruiken als onderzoeksobjecten met het uiteindelijke doel de wereld te overheersen. Twee handlangers, Schwarz en Weiss, houden Braviary gevangen terwijl ze op de terugweg zijn naar hun hoofdkwartier. Ze komen echter al snel voor een wegversperring, opgezet door N. Hij gebruikt de afleiding om hun wagen open te breken en Braviary te bevrijden en de twee ontsnappen. Ze zijn echter beide gewond geraakt door de mannen en Braviary heeft een verborgen zendertje aan zijn nek.
Ondertussen zijn onze helden op weg naar de Witte Ruines, als ze het gewonde paar tegenkomen. Ze gaan allemaal naar het Pokémon Center, waar zuster Joy Braviary’s gewonde vleugel verbindt. Tijdens een geheimzinnige black-out, veroorzaakt door Team Plasma, ontdekt N het zendertje en realiseert zich dat hij Braviary daar snel weg moet halen. Hij legt zijn plan uit aan Ash en de anderen en ze komen in actie. Schwarz en Weiss gaan achter het signaal van de zender aan, maar ontdekken al snel dat het N is die ze afleidt om ze weg te lokken, terwijl Ash, Iris en Cilan Braviary in veiligheid brengen.
Maar Braviary voelt dat N in gevaar is en blijft zich inspannen en roepen tot onze helden erachter komen wat er aan de hand is. Zij keren terug, net op tijd om te zien dat N wordt aangevallen door de Pokémon van de handlangers. Ash weet dat N een hekel heeft aan Pokémon gevechten, maar er lijkt geen andere keus te zijn en een hevig gevecht barst los: Zangoose en Seviper aan de kant van de vijanden, tegen Pikachu van Ash en Excadrill van Iris, met wat hulp van de wilde Braviary, die het tij keert in het voordeel van onze helden. Schwarz en Weiss vluchten met de belofte om Braviary een andere keer te vangen. Het is eindelijk tijd dat Braviary terugkeert naar de natuur en tijd dat onze helden hun reis vervolgen, maar dit keer gaat N met ze mee.