Lysandre’s dreigement aan de wereld gaat door, maar onze helden hebben zich opgesplitst en vechten terug op verschillende fronten. Ash en Alain vechten tegen Lysandre en Malva sluit zich solidair bij hen aan. Ondertussen staat Bonnie tegenover Zygarde en zingt haar Gompielied door haar tranen heen en de macht van Team Flare vervaagt als Zygarde zich weer verbindt met zijn vriendin.
Clemont gaat de Prisma Toren in om Xerosic te verslaan en Clembot sluit zichzelf aan op het controle systeem in een poging om het uit te zetten. Als dit lukt zal zijn geheugen gewist worden, maar Clembot houdt vol dat ze geen andere keus hebben en Clemont moet dit tot zijn spijt toegeven. Hij volbrengt de taak en de machine van Team Flare is afgesloten.. vooralsnog..