Team Rocket heeft meegeluisterd met de les van Ash over Z-Kristallen en nu moeten zij er een hebben! Dankzij het onderzoek van James, ontdekken ze een Duister soort Z-Kristal, verankerd in een hoge rots en bewaakt door een enorme Totem Pokémon, Alolan Raticate. Team Skull duikt ook op en dan barst de rivaliteit los!
Tupp, de blauwharige leider van de drie Team Skull leden, is als eerste bij het Z-Kristal. Hij weet het kristal los te peuteren, maar het valt en raakt Meowth op zijn hoofd. Nu Team Rocket het Z-Kristal heeft, moeten ze er nog achter komen hoe ze het moeten gebruiken..