Wanneer de Piplup van Dawn door een geheimzinnig portaal wordt genomen door iemand die precies op Dawn lijkt, vraagt ze Ash om hulp en Goh en Chloe komen mee. En wanneer een ongewoon competente versie van Team Rocket uit een ander portaal opduikt en Lucario en Inteleon steelt, gaan Dawn en Goh ze achterna in de parallelle wereld, een wereld zonder Pokémon. Ze ontmoeten de andere Dawn, die uitlegt dat de tijd in haar wereld achteruit loopt, waardoor Pokémon hun zetten vergeten, terug-evolueren en zelfs weer Eieren worden. Na wat onderzoek met Cynthia, de Kampioen van Sinnoh, komen Ash en Chloe ook aan in de andere wereld. Kunnen zij het mysterie oplossen?