Wanneer Ash de Legendarische Pokémon Solgaleo en Lunala in zijn dromen ziet, doet hij ze een belofte. Maar als hij wakker wordt, weet hij niet meer wat het was! Zal de vreemde Pokémon die Nebby heet, zijn geheugen opfrissen? Samen met hun nieuwe vrienden en de rest van de leerlingen van de Pokémon School, verkennen Ash en Pikachu de Aether Foundation, een organisatie die zich wijdt aan Pokémon opvang en verzorging. Maar die kon wel eens niet zo onschuldig zijn als hij lijkt, en Ash en zijn vrienden moeten samenwerken om de mensen en Pokémon waar zij om geven te beschermen wanneer zij tegenover een geheimzinnige macht komen te staan die in niets lijkt op wat ze eerder hebben gezien.