Etter at våre helter spent når land og legger til på Lily Of The Valley-øyen for Sinnoh League konkurransen, gjør Ash ferdig registreringen sin, og ringer professor Oak for å takke ham for "lykke til"-blomstene og kortet Oak har sendt. Ash spør professoren om han kan sende Ash sine Pokémon fra lab'en, og det sier professoren rungende ja til.
Men Team Rocket har en plan om å stjele Ash sine Pokémon i prosessen, og tar fem av dem i overføringen. Snart blir de blåst avsted igjen, men uheldigvis med Ash sine Pokémon også!
Så våre helter setter avsted for å finne Ash sine forsvunne Pokémon, og en etter en blir Corphish, Totodile, Snorlax, Bayleef og Cyndaquil funnet i god behold, men ikke i sine Poké Balls.
Men Team Rocket er ikke ferdige enda, og de setter igang et angrep med en robot som heter Magiske hansker og virker uslåelig! Men Cyndaquil utvikles til Quilava under kampen, og bruker sit nyerhvervede Eruption trekk til å sørge for at Team Rocket blir blåst avsted for andre gang.
Når åpningsseremonien begynner, legger Ash merke til at Nando, Barry og Conway konkurrerer... og Paul også. Og så, i det Ash sin første kamp blir mot Nando, forlater vi Ash i begynnelsen av det neste kapittelet i hans reise mot å bli en Pokémon Mester!