På vei mot Nimbasa City og Ash sin neste Gym-kamputfordring, blir heltene våre overrasket av et voldsomt uvær med regn, torden og lyn. De oppdager et herskapshus, og de går inn der for å komme unna det dårlige været, men de finner ingen der.
Det viser seg at det er bebodd av en flokk med Litwicker og ingen andre enn Team Rocket befinner seg også der. Jessie, James og Meowth mener at herskapshuset vil være en perfekt hemmelig base for dem, og når de i all hemmelighet oppdager at Dustene er der også, ber de Litwickene(vi deres Yamask) om å fange Pikachu og jage resten av dem vekk. Men Litwickene har andre planer.
Selv om Litwickene prøver å forhindre heltene våre fra å finne ut om dem på Ash sin Pokédex, finner de til slutt ut at Litwickene ser ut til å hjelpe å lede folk ved å lyse opp steder som ligger i mørket, men i virkeligheten leder de dem til Spøkelsesverdenen. De livnærer seg på livsenergien til mennesker og Pokémon, og bruker den som brensel for flammene på hodene deres. Samtidig blir Team Rockets livsenergi tappet av Litwickene, så heltene våre og Team Rocket slår seg sammen. Etter noen voldsomme kamper med alle deres Pokémon, blir Litwickene (og Lampentene som har gått i lag med Litwick-kvartetten) sendt til Spøkelsesverdenen.
Team Rocket tar farvel, men de lover å fange Pikachu en dag, og heltene våre har nok engang blikkene festet mot Nimbasa City.