Når heltene våre fortsetter reisen mot Nimbasa City, finner vi ut at et kraftig og farlig uvær nettopp hadde rammet skogen før de ankom, som førte til at en Cubchoo kom bort fra sin familie og sine venner.. Men når de finner den fortapte Cubchoo og prøver å returnere den til en gruppe med sinte Beartic, som de antar er venner av den, informerer den triste Cubchoo våre helter(med Meowth som oversetter) at stormen skilte den fra sine venner, men det er alt den husker. Men en fjelloppsynsmann med navn Cliff (og Mienfoo, partneren hans) forteller at det er to grupper med Beartic og Cubchoo som lever i fjellet, og de mystiske og sinte Beartic de møtte var fra den andre gruppen. Når de skal prøve å få den fortapte Cubchoo tilbake til vennene sine, møter de på flere sinte Beartic fra den andre gruppen og Bearticenes voldsomme angrep skiller Meowth, Cubchoo og flere Pokémon fra våre helter.
Når de leter etter mat til de sultne Pokémon, finner Meowth noen bær. Men bærene tilhører de sultne og sinte Beartic fra den andre gruppen, og Meowths forhandlingsevner settes på prøve. Han mislykkes dessverre og akkurat i det det ser u som det verste skal skje, jobber begge Beartic-gruppene sammen og alle blir reddet. Cubchoo blir gjenforent med sine venner, de to Beartic gruppene slutter fred med hverandre og våre helter kan igjen sette kurs for Nimbasa City.
Samtidig begynner den ondsinnede planen til Jessie og James om å slå til mot Nimbasa City undergrunnen å ta forme. Ingo og Emmet, Undergrunnsjefene er fast bestemt på å komme til bunns i dette. Men Jessie og James er trygge på suksess, selv om Dr. Zager advarer dem om å styre klar av myndighetene...