Heltene våre har blitt inviteret av den eldste professor Juniper (Cedric) for å bli med ham å utforske en ruin, som det går rykte om har vært møtestedet mellom “Helten” og Zekrom for lenge siden. Cedric leser så opp et avsnitt fra seksjon atten av det Svarte Kapittel fra Pokémon-mytologien for heltene våre: “Når Helten forvandler mørke til lys og hjertet hans blir ett med Pokémonen, da skal Zekrom komme ned og låne Helten sine krefter.”
Når de ankommer ruinen, advarer Cedric heltene våre heltene våre om at den kan være full av feller, og det er det de oppdager. Dere første krise inntreffer når en kjempestor stein kommer rullende mot dem nedover en trang passasje og truer med å meie dem ned, men Pansage bruker Dig og heltene våre klarer å komme seg i trygghet.
Det neste som skjer er at de møter på to broer som krysser en dyp kløft, men det viser seg at begge broene er full av farer. Men Axew finner en annen vei.
Når de står overfor tre grotteinnganger, må de bestemme seg for hvilken inngang som er den rette. De prøver en om gangen. Når de går inn den tredje inngangen, kommer de inn i et stort rom formet som et vulkankrater, hvor de oppdager flere steinpilarer og den Gyldne Mørke Stein...og en sint Sigilyph! Selv om Cedric advarer heltene våre om ikke å røre steinen, griper han den selv De møter da på flere illsinte Cofagrigus.
Når alt virker håpløst, forteller Cedric dem om en passasje fra den Svarte Kapitlet om Pokémon-mytologi: “Zekrom lånte kreftene sine til Helten så snart hjertet hans ble ett med Pokémonen”.
Når Ash og vennene hans husker alle de fantastiske stundene de har delt med deres Pokémon og hvor mye de elsker dem, redder Sigilyph og Cofagrigus plutselig dem.
Selv om Iris ikke er begeistret over farene eventyret deres førte med seg, er Ash og Cilan derimot kjempefornøyd med hvor gøy de har hatt det. De takker Cedric og tar farvel med deres nye venn.
Plutselig står en truende Krokorok foran dem...
