Team Rocket har tatt til fange Meloetta, brakt den til Undervannstempelet og brukt et opptak av Meloettas sang for å heve tempelet til overflaten. Nå, fortsetter Operasjon Uvær, i det Giovanni får tak i det mystiske Sannhetsspeilet og bruker det til å kalle på de tre Pokémon-legendene Tornadus, Thundurus og Landorus!
Meloettas beskytter, Ridley, forklarer at den som kontrollerer Meloetta også kontrollerer disse tre gamle kreftene. Team Rockets plan er bare det siste av mange forsøk av ugjerningsmenn i løpet av årene på å ta over Unova-regionen ved å bruke kreftene til Sannhetsspeilet. Heltene våre ser på i frykt i det de tre Pokémon-legendene forandres til Totem Forme og forbereder seg på å volde skade på Unova!
Ash og Pikachu klarer å flykte fra deres fangenskap, og en enorm Pokémon-kamp begynner å ta form: Iris sin Dragonite, Cilans Pansage, Cynthias Garchomp, Ridleys Golurk og Ash sin Unfezant slutter seg til Pikachu for å ta opp kampen mot de skremmende Tornadus, Thundurus og Landorus. Et raskt angrep fra Thundurus slår nesten Iris ned, men Pikachu kaster seg inn i lynets bane for å beskytte henne. Så, med den ekstra elektrisiteten den absorberte fra angrepet, sender Pikachu av sted en massiv Electro Ball som overmanner Team Rocket og befrir Meloetta!
Men Giovanni er fremdeles i besittelse av Sannhetsspeilet, og uten Meloettas beroligende innflytelse, blir han fullstendig overveldet av onde ambisjoner: i stedet for å erobre Unova-regionen, ønsker han nå å tilintetgjøre den! Men Jessie, James og Meowth intervenerer for å styre sjefen deres bort fra denne katastrofale vei, og når han kommer til sinne fulle fem, trekker Team Rocket seg motvillig tilbake.
Ridley bruker så Sannhetsspeilet for å sende de tre Pokémon-legendene tilbake til deres legemliggjorte Forme, og Meloetta beroliger deres raseri med en sang. Når katastrofen er avverget, tar Ridley og Meloetta farvel og forbereder seg på å vende hjem igjen. Men Ash vet at de vil møtes igjen en dag, og alle øyne rettes igjen mot Unova-ligaen!