På jakt etter et ønske!

Mens de fortsetter reisen rundt Decolore-øyene på vei mot Kanto-regionen, utforsker heltene våre en steinete, gold del av Rommesli-øya. Etter at de setter opp leir for natten, blir Pikachu og Axew vekket av den mytiske Pokémon Jirachi! Det blir sagt at Jirachi våkner hvert tusende år og da bare i syv dager. Når Pikachu og Axew leker med Jirach våkner de andre av bråket, og når Ash forstår hva han ser blir han opprømt og løper fram for å bli venner med den, noe som skremmer Jirachi bort.  Neste morgen, mens Ash, Cilan og Iris snakker om at de så Jirachi, dukker en jente kalt Gemma opp og ber dem om å fortelle hvor den ble av. Det viser seg at hun desperat ønsker at Jirachi skal oppfylle ønsket hennes - å gi tilbake liv til fjellet hvor hun bor slik at det blir vakkert og grønt igjen. Senere, når de møter Gemmas mor, blir heltene våre fortalt at hennes mann har vært på en reise i nesten to år for å finne ut hvorfor fjellet har tørket opp og blitt så goldt. En av de mange grunnene til at Gemma er så desperat etter å få ønsket sitt oppfylt er sånn at faren kan komme hjem igjen!  Det er bare syv dager før Jirachi går tilbake i dvale for nye tusen år, så Ash og vennene hans tilbyr seg å hjelpe Gemma med å finne den flyktige Pokémon og få ønsket hennes oppfylt. Den første gangen de finner den nærmer de seg for bort og den flykter igjen. Men de fortsetter letingen, dag etter dag - og de er ikke de eneste. Jessie, James og Meowth vil også ha kloa i den mytiske Pokémon!  Endelig, på den syvende dagen, finner de Jirachi igjen og denne gangen holder Gemma seg rolig. Jirachi samtykker når hun ber om ønsket sitt, men så blir den fanget av Team Rocket! Men Gemmas mot, våre helters kampferdigheter og Jirachis fantastiske evner setter samlet Jirachi fri og sender Team Rocket avgårde igjen.  Jirachi er utslitt og skadet etter hendelsene. Gemmas far ankommer og leder alle opp til Fjellets Helligdom, hvor Gemma har et nytt ønske. Hun vil bare at Jirachi skal ha det bra. Ønsket går i oppfyllelse og etter hvert som Jirachi får tilbake energien sin begynner vann på nytt å flomme fra innsiden av fjellet. Familien til Gemma er endelig sammen igjen og fjellet er i ferd med å helbredes.  Jirachi går endelig tilbake til sin tusenårige dvale og heltene våre fortsetter reisen sin.