På vei til Pomace-fjellet og Korrinas spesialtrening, havner våre helter i en labyrint av en hule, der de støter på en flokk opphissete Noibat som har blitt skremt av Team Rocket-trioen som en del av deres onde plan! I forvirringen kommer vennene fra hverandre: Ash, Serena, Bonnie og Lucario havner utenfor den ene siden av hulen, mens Clemont, Korrina og Pikachu havner utenfor den andre. Kjeltringene utnytter muligheten til å slå til mot Clemonts gruppe, og takket være "Mecha-evolusjons-forsterkeren" som sitter fast på Team Rockets Pokémon, får de raskt overtaket. Samtidig har Lucario fornemmet Korrinas nærvær, og takket være båndet deres og speider-egenskapene til Ash sin Fletchling, blir de to gruppene gjenforent - men selv Lucario klarer ikke å vinne over Team Rockets teknologi. Som en siste løsning Mega-utvikler den seg igjen, og mister med en gang kontrollen når den mektige auraen overdøver Korrinas stemme. Men Korrina gir ikke opp, og Mega Lucario klarer å få kontroll lenge nok til å blåse Team Rocket avsted igjen, før den kollapser, helt utslitt. Reisen deres har bare så vidt begynt..