På veien til Snowbelle City oppdager Bonnie en liten, grønn Pokémon som gjemmer seg i vesken hennes. Pokédex greier ikke å identifisere den, så hun kaller den for Myki. Snart treffer heltene våre sin venn Sawyer og hans Grovyle. Gjenforeningen blir avbrutt av en gruppe i røde klær som er fast bestemt på å få tak i Bonnies nye venn! Disse nye skurkene er Team Flare, og de har identifisert Myki som en av Kjernene de trenger for den mystiske Operasjon Z. Ash og Sawyer står sammen for å drive dem vekk, men de legger nye planer, og Team Rocket holder øye med dem... Sawyer foreslår at de bør stoppe ved Terminus-grotten på vei til Snowbelle City, og Myki er ivrig med på planen, så våre helters neste destinasjon er fastslått!