Heltene våre besøker Aether-paradiset, en del av Aether Foundation som drives av moren til Lillie, Lusamine. Det bor et imponerende utvalg Pokémon i reservatet, inkludert en gruppe Ditto som trenger vaksine! Professor Burnet får Ash og vennene hans til å hjelpe til med vaksinene mens Lusamine er opptatt i telefonen, men en av dem slipper unna og fører heltene våre på en lystig jakt mens den stadig forandrer seg. Til slutt fanger de den når den ser ut som Snowy og Lillie innser at hun ikke kan ta på den!  ...I mellomtiden har Team Rocket-trioen skaffet seg jobb på Aether-paradiset, og de er hakk i hæl på Nebby når de støter på Faba sitt mystiske laboratorium...