Ash er tilstede under åpningen av professor Cerises nye forskningssenter i Vermilion City, men dagen tar en uventet vending når den legendariske Pokémon Lugia dukker opp i nærheten! Ash skynder seg for å kjempe mot den, men når han hopper opp på ryggen dens, oppdager han at han ikke er alene! En gutt som heter Goh er også der, og han dokumenterer alt han kan om Lugia. Lugia tar Ash og Goh med på et fantastisk eventyr, og Goh filmer alt sammen. Professor Cerise er så imponert over resultatet at han tilbyr Ash og Goh å bli forskningsassistenter ved laboratoriet, og begge takker ja med glede!