Når Ash ser de Legendariske Pokémon Solgaleo og Lunala i en drøm, lover ham dem noe. Men når han våkner, så husker han ikke hva det var! Vil den merkelige Pokémon de kaller Nebby hjelpe ham med å huske? Ash og Pikachu utforsker Aether Foundation, en organisasjon for bevaring og pleie av Pokémon,  sammen med den nye vennen sin og resten av elevene ved Pokémon-skolen. Men organisasjonen er kanskje ikke så uskyldig som den ser ut til, og Ash og vennene hans må samarbeide for å beskytte folk og Pokémon de bryr seg om når de står overfor en mystisk kraft som ikke ligner noe de har sett før.