På sin fortsatta resa mot Icirrus City och Ashs nästa Gym-strid, går våra hjältar vilse inne i Twistbergets många grottor. De springer då på en Pokémon-forskare som heter Ferris, som just har upptäckt ett Pokémon-fossil av en forntida Prototurtle Pokémon, Tirtouga.
De blir kort därefter utschasade från berget av Ferris barndomsväninna, som heter Sierra, som numera leder gruvdriften i berget.
Hemma hos Ferris får vi sen veta, att när han var barn, så svär han på att han träffade och lekte med Tirtouga inne i berget!
Under tiden som han och våra hjältar har teorier om att det hände på grund av någon sorts rumtids-krökning, så planerar Team Rocket (ihop med Doktor Zager) att stjäla och återskapa Skyddsfossilet till ett levande djur, som de behöver för att kunna resa tillbaka i tiden genom samma rumtids-krökning (Tidsportalen, en dörr in till det förflutna) som Ferris använde som pojke när han mötteTirtouga. Planen är att resa till det förflutna, stjäla så många forntida Pokémon som möjligt och ta med dem till den moderna världen, och på så vis kunna styra Unova-regionen.
Våra hjältar vill såklart inte gå med på detta och striden börjar.Team Rocket har dock byggt en mängd skyddsanordningar och våra hjältar verkar inte kunna ta sig igenom dem. Plötsligt rymmer den återskapade Tirtouga och Ash och Ferris jagar hysteriskt efter den.
Avsnittet slutar just som de försöker övertyga en ilsken Tirtouga om att de inte menar något illa, medan Team Rocket är fast beslutna att fånga Tirtouga och fullföja sin plan; att ta över och styra Unova-regionen.
