I ett mörkt laboratorium experimenterar vetenskapsmannen Colress på en vettskrämd Galvantula, i ett försök att öka dess attack-styrka genom att använda elektro-magnetiska vågor. Han förefaller vara en del av en mystisk organisation, som heter Team Plasma, och som vill ta kontroll över hela Unova… Under tiden är våra hjältar på väg till de Vita ruinerna via Floccesy Town, och blir då attackerade av tre arga Amoonguss! Ash, Iris och Cilan bekämpar dem och tar dem sedan till Pokémon Center, där de upptäcker att det är helt fullpackat! Syster Joy förklarar att flera Bergs-Pokémon har kommit in till staden, och attackerat folk utan någon synbar anledning, och en Tränare nämner att han har sett några främlingar drälla omkring vid det övergivna observatoriet, nära toppen. Ash och de andra beger sig av för att undersöka saken, och de är på väg uppför berget, när en skäggig typ avråder dem från att fortsätta, eftersom det är för farligt. Det visar sig snart att han har rätt, när alla Pokémon i närheten – inklusive Pikachu och Axew – plötsligt vänder sig mot dem och börjar attackera! Mannen tar fram en apparat som skyddar alla Pokémon från de skadliga EM-vågorna, och medan de lugnar ned sig, tar han av sig sin förklädnad: Han visar sig vara Kriminalpolis Looker från Internationella Polisen, senast sedd i färd med att jaga ifatt Team Galactic i Sinnoh, och nu i hasorna på Team Plasma! Han har spårat dem till det övergivna observatoriet, och naturligtvis bestämmer sig våra hjältar för att följa med och hjälpa till. När de konfronterar Team Plasma inne i observatoriet, menar Colress att Pikachu skulle vara det perfekta försöks-objektet för hans experiment. Det uppstår ett spänt ögonblick när Pikachu kämpar mot den kontrollerande kraften från Colress maskin – men bandet mellan Ash och Pikachu är starkare än någon EM-våg, och Pikachu bryter sig loss. Colress håller på att uttrycka sin förtjusning över den här utvecklingen, när han upptäcker en främmande apparat som är kopplad till hans maskin och stjäl hans forskningsresultat; det är Team Rocket! De snor en del av utrustningen vilket gör att alla Bergs-Pokémon blir fria från vetenskapsmannens kontroll, och flyr i sin ballong! Men en missil från Team Plasmas luftskepp gör att de störtar igen. Looker inser att all övrig utrustning är inställd på att förstöra sig själv, och får kvickt ut allihop ur byggnaden, innan observatoriet exploderar och alla bevis på Team Plasmas närvaro och Colress experiment förstörs. Han svär att gå till botten med Team Plasmas ondskefulla planer och Ash och de andra önskar honom lycka till när han ger sig av, och återupptar sedan sin resa mot de Vita ruinerna .