På sin fortsatta tur runt Decolore-öarna på väg till Kanto-regionen, utforskar våra hjältar en bergig och karg del av Spatiösia-ön. Efter att de tagit kväll, och slagit läger, blir Pikachu och Axew väckta av en Mytisk Pokémon, Jirachi! Det sägs att den vaknar upp vart tusende år, och är då bara vaken i sju dagar. När Pikachu och Axew leker och skojar med Jirachi, väcker deras oväsen resten av våra hjältar, och då Ash inser vad det är han ser, blir han helt till sig och springer fram för att bli vän med Jirachi… och skrämmer samtidigt iväg den. Nästa morgon, medan Ash, Iris och Cilan pratar om mötet med Jirachi, springer en tjej vid namn Gemma fram till dem och ber dem berätta vart den tog vägen. Det visar sig att hon desperat vill att Jirachi ska uppfylla hennes önskan: Att återställa berget till dess tidigare frodiga och gröna tillstånd. Senare, när de träffar Gemmas mamma, får våra hjältar veta att hennes man är i väg på en resa sedan nästan två år tillbaka, och att han försöker ta reda på varför berget har torkat ut och blivit kargt. Ett av de många skälen till varför Gemma så desperat vill få sin önskan uppfylld; är för att då kan hennes pappa kom hem igen! Eftersom det bara är sju dagar kvar tillsJirachi somnar i tusen år igen, erbjuder sig Ash och hans vänner att hjälpa Gemma att hitta den gäckande Jirachi och få hennes önskan uppfylld! Första gången de hittar den, närmar de sig för snabbt och den flyr igen. Men de fortsätter leta, dag efter dag; och de är inte de enda. Jessie, James och Meowth vill också lägga vantarna på denna Mytiska Pokémon! Till slut, på den sjunde dagen, hittar de Jirachi igen, och den här gången håller sig Gemma lugn. När hon ber om att få sin önskan uppfylld säger Jirach ja; bara för att strax bli fångad av Team Rocket! Men kombinationen av Gemmas mod, våra hjältars strids-skicklighet och Jirachis otroliga krafter gör att Jirachi blir fri och att Team Rocket far iväg igen. Jirachi är utmattad och skadad efter att ha behövt gå igenom en sådan pärs. Gemmas pappa kommer dit och leder dem upp till Bergs-templet, där Gemma gör en ny önskning; hon vill bara att Jirachi ska bli bra. Hennes önskan uppfylls och när Jirachi återfår sin energi börjar vattnet flöda fram inifrån berget. Gemmas familj är återförenad, berget är på väg att återhämta sig och Jirachi återgår till sin tusenåriga sömn, allt medan våra hjältar fortsätter sin resa.