En busca de un lugar tranquilo para entrenar, Ash y sus amigos llegan a una isla virgen antiguamente habitada por un Pokémon ancestral extinguido ya. Con su aguzada vista, Max avista un Cradily, un Pokémon que se creía que se había extinguido, oculto entre los arbustos. ¿O se habrá confundido? Mientras sus amigos no le hacen demasiado caso, Max se propone encontrar a este Pokémon “extinguido” para salvaguardar su reputación. En otro lugar, Ash, Aura y Brock empiezan a creerse la historia de Max cuando conocen a unos científicos que afirman ser capaces de revivir fósiles de los Pokémon extinguidos Cradily, Lileep, Anorith y Armaldo. Mientras, armados con un barco muy poco respetuoso con el medio ambiente, el Team Rocket intenta robar estos Pokémon anacrónicos. ¿Podrán nuestros héroes atravesar milenios y convencer a estas ancestrales criaturas de que se unan en su lucha contra el Team Rocket?